Die Kirche Santa María de Comares wurde in den 1530er Jahren an der Stelle der ehemaligen Moschee nach dem Vorbild von Santa María la Mayor de Vélez errichtet. Sie ist somit das zweite christliche Gotteshaus, das in La Axarquía errichtet wurde. Zuerst wurde die Hauptkapelle gebaut und Jahre später die drei Schiffe mit gotischen Backsteinbögen und schönen Holzkassettendecken im Mudéjar-Stil. Die Ausrichtung der Moschee wurde beibehalten, obwohl die Richtung des Gottesdienstes geändert wurde.