Die Höhle von Boquete de Zafarraya befindet sich an den südlichen Hängen des Alhama-Gebirges, in der Gemeinde Alcaucín. Seine Mündung befindet sich im Südwesten der beeindruckenden Schlucht, die von einem alten Flussbett und dem bekannt als "Boquete de Zafarraya", eine natürliche Besonderheit, die die Landschaft der oberen Axarquia dominiert.
Obwohl die Höhle den Höhlenforschern von Málaga bereits seit den 1970er Jahren bekannt war, begannen erst 1981 die ersten archäologischen Ausgrabungen in der Höhle, die bis 1983 andauerten.
Zwischen 1990 und 1994 wurden die Arbeiten in der Höhle von einem internationalen Forschungsteam fortgesetzt. Obwohl es sich nicht um eine große Höhle handelt, beherbergt sie eine Stätte mit einer sehr umfangreichen erhaltenen Abfolge, die im Mittelpaläolithikum beginnt und im Neolithikum endet, obwohl es auch materielle Beweise für eine gewisse Nutzung oder Frequentierung während des Mittelalters gibt.
Sie ist eine der wichtigsten Stätten für die Erforschung des europäischen Jungpleistozäns.