El aljibe (del árabe al-yubb) es uno de los escasísimos restos conservados de la antigua mezquita mayor tras ser destruida. Es una construcción abovedada de ladrillo para almacenar el agua, especialmente la de lluvia, que era usada por los fieles para lavarse antes de hacer la oración mediante el wudu o ablución. Se halla bajo el piso del altar mayor de la actual iglesia de Santa María y tiene su acceso por el patio. Al-Wansharisi (s. XV) cita la mezquita en su obra al referir como los campesinos llegaban a Vélez y... “en la plaza delante de la mezquita mayor donde intercambian mercancías por aceite, y meten los higos hasta el patio de la mezquita, los tienden al sol y empaquetan”.