La grotte de Boquete de Zafarraya est située sur le versant sud de la Sierra de Alhama, dans la commune de Alcaucín. Son embouchure est située au sud-ouest de l'impressionnante gorge creusée par un ancien lit de rivière et de l'embouchure du fleuve. connu sous le nom de "Boquete de Zafarraya", une caractéristique naturelle qui domine le paysage de la Haute Axarquia.
Bien que la grotte soit connue des groupes spéléologiques de Malaga depuis les années 1970, ce n'est qu'en 1981 que les premières fouilles archéologiques ont commencé à l'intérieur de la grotte, et ce jusqu'en 1983.
Par la suite, entre 1990 et 1994, les travaux se sont poursuivis dans la grotte par une équipe de recherche internationale. Bien qu'il ne s'agisse pas d'une grotte de grande taille, elle abrite un site avec une séquence conservée très étendue qui commence au Paléolithique moyen et se termine au Néolithique, bien qu'il y ait également des preuves matérielles d'une certaine utilisation ou fréquentation au cours du Moyen-Âge.
C'est l'un des sites les plus importants pour l'étude du Pléistocène supérieur européen.